IBM，白宫，能源部和其他机构发起联合体，使冠状病毒研究人员能够使用超级计算机

 
在2020年全球代码征集挑战赛启动之后，IBM今天宣布，它将帮助协调努力，为研究COVID-19的科学家提供330 petaflops的计算能力，这是一种使30万人患病的冠状病毒。该公司预计将使用该功能来开发算法，以评估COVID-19的进展情况，并为寻找可能的疫苗建立潜在疗法的模型。
这些高性能的计算系统使研究人员可以在流行病学，生物信息学和分子建模中进行大量计算。如果手动进行，这些实验将需要数年才能完成，如果在较慢的传统计算平台上进行，则将花费数月。” IBM研究总监Dario Gil在博客中写道。 “自从COVID-19大流行开始以来，我们一直与美国和世界各地的政府紧密合作，以找到所有可用的选项，以使我们的技术和专业知识能够发挥作用，以帮助组织恢复活力并适应大流行的后果。”
作为新成立的联盟-COVID-19高性能计算(HPC)联盟的一部分，该联盟包括白宫科学技术政策办公室，美国能源部，麻省理工学院，伦斯勒理工学院，劳伦斯·利弗莫尔国家实验室，阿贡国家实验室，橡树岭国家实验室，桑迪亚国家实验室，美国宇航局洛斯阿拉莫斯国家实验室以及美国国家科学基金会，微软，谷歌，惠普企业和亚马逊，IBM表示将协助评估机构的提案并提供访问为可以“产生最直接影响”的项目进行计算。团队将可使用16个系统，这些系统结合了775,000个处理器内核和34,000个GPU，它们每秒可执行约3,300亿次浮点运算(330 petaflops)。
“我们要确保致力于对抗COVID-19的研究人员能够使用他们所需的工具，” Microsoft AI for Health计划全球负责人John Kahan说。 “通过我们的AI for Health计划，我们亲眼目睹了利用强大技术为才华横溢的研究人员赋能的影响。我们希望通过扩大对Azure云和高性能计算功能的访问，并通过创造更多与我们自己的数据科学家合作的机会，来帮助加快这项重要工作。”
研究人员将从今天晚些时候开始可以通过网站进行申请。他们必须说明国家实验室或其他机构的工作人员的支持对他们的项目而言是否必不可少，有用或不必要，以及是否可能存在任何限制，例如专有数据集或HIPAA限制。
亚马逊的亚马逊网络服务(AWS)部门最近发起了一项2000万美元的计划来对抗冠状病毒，该公司表示，它将为研究机构和公司提供技术支持和促销信用，以利用AWS计划推进COVID-19在诊断，治疗和治疗方面的研究。疫苗研究。 AWS全球公共部门副总裁Teresa Carlson表示：“我们为能够支持这项关键工作感到自豪，并为AWS的计算能力做好了准备，以帮助加快研发工作。” “政府，企业和学术界的领导者可以一起工作，利用云的力量来推动科学发现和创新的步伐，并帮助对抗COVID-19病毒。”
对于Rensselaer理工学院而言，它将在全球最大的24强超级计算机Rensselaer计算创新中心(其全球最大的24强超级计算机)中使用其人工智能多处理优化系统(AiMOS)计算机。 Rensselaer表示，它正在与包括政府实体，大学和行业在内的研究社区进行接触，以提供对AiMOS的访问，以支持与COVID-19相关的研究。
Google Cloud全球公共部门副总裁Mike Daniels表示：“我们知道，高性能计算可以将处理海量数据集和执行复杂模拟的时间从几天缩短到几小时。” “我们期待与技术，学术界和公共部门的领导者一起参加这项计划，以为COVID-19研究人员提供更多资源，并将Google Cloud计算功能应用于潜在疗法和疫苗的开发。”
在宣布这一消息之前，有消息称科学家们在世界上最快的超级计算机橡树岭国家实验室的IBM峰会上进行了模拟，以模拟8000种不同分子如何与COVID-19相互作用，从而导致分离出77种可能使该病毒无法感染宿主细胞的化合物。在其他地方，天津国家超级计算机中心的天河一号超级计算机最近用于处理由计算机断层扫描生成的数百幅图像，并在几秒钟内做出诊断。由德国三个国家超级计算中心组成的联盟高斯超级计算中心表示，它将帮助从事COVID-19的人员获得对计算资源的快速访问。
最近，Folding @ home是世界上最大的众包超级计算程序之一，它启动了一项计划，以揭示COVID-19刺突蛋白背后的奥秘，该病毒可用来感染细胞。据项目组织者和华盛顿大学医学院生物化学与分子生物物理学副教授格雷格·鲍曼(Greg Bowman)称，自2月下旬宣布对冠状病毒的新关注以来，已有约40万名新志愿者加入了这项工作。
长期以来，超级计算机一直用于识别和测试复杂和慢性疾病的潜在治疗方法。研究人员利用了德克萨斯高级计算中心的Lonestar5集群来模拟1400多种FDA批准的药物，以查看它们是否可用于治疗癌症。去年六月，在整个欧盟范围内选择了八个超级计算中心。托管个性化医学和药物设计中的应用程序。制药公司TwoXAR最近与斯坦福大学亚洲肝脏中心合作，筛选了25,000种成人肝癌候选药物。
希望超级计算机可以减少将新药推向市场所需的时间。进入临床试验的所有药物中，只有不到12%进入药房，并且药物至少需要10年才能完成从发现到上市的过程。根据美国药物研究与制造商的数据，仅临床试验一项平均就需要6至7年的时间，这使研发成本增加了约26亿美元。
美国首席技术官Michael Kratsios在今天的新闻中说：“美国正在团结起来，共同对抗COVID-19，这意味着释放我们世界一流的超级计算机的全部能力，以迅速推进治疗和疫苗的科学研究。” “我们感谢私营部门和学术界领袖，他们作为特朗普政府对整个美国的回应之一而加入联邦政府。”
白宫先前与Google母公司Verily合作开发筛选技术，以建立分类工具，以帮助人们在美国找到COVID-19测试地点，目前该地点可在旧金山湾区的特定地点使用。 (Google还在与美国政府合作，为那些想知道是否应该寻求医疗救助的人们创建自我检查工具。)上周，应白宫科学技术政策办公室的要求，艾伦研究人员和领导人AI研究所，Chan Zuckerberg Initiative，Microsoft，美国国立卫生研究院的国立医学图书馆等发布了超过29,000篇关于COVID-19，SARS-CoV-2和冠状病毒小组的文章。
今天下午，在特朗普发布援引《国防生产法》的行政命令几天后，美国总统特朗普就赋予福特，通用汽车和特斯拉“前进”的力量，以使通风机缓解大流行中的短缺。 COVID-19是一种呼吸系统疾病，呼吸机是用于治疗住院患者的重要医疗设备。重症监护医学协会预测，未来可能需要在美国有960,000例冠状病毒患者使用呼吸机，但美国只有约200,000台这样的机器，而大约一半的机器是较旧的机型，可能不适合用于危重病人生病的病人。